Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH3Q8TBE1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNIH3Q8TBE1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms