Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVIPQ8NHG7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SVIPQ8NHG7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms