Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SETD9Q8NE22 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD9Q8NE22 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SETD9Q8NE22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SETD9Q8NE22 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms