Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM71DQ8N9W8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM71DQ8N9W8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM71DQ8N9W8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM71DQ8N9W8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms