Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVOPQ8N4V2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVOPQ8N4V2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVOPQ8N4V2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVOPQ8N4V2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SVOPQ8N4V2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SVOPQ8N4V2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVOPQ8N4V2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms