Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHTF2Q8N3S3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF2Q8N3S3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF2Q8N3S3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF2Q8N3S3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms