Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SVBPQ8N300 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SVBPQ8N300 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SVBPQ8N300 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms