Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGI4Q8N135 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGI4Q8N135 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGI4Q8N135 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms