Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FUNDC1Q8IVP5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FUNDC1Q8IVP5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FUNDC1Q8IVP5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FUNDC1Q8IVP5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms