Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L2Q6R6M4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
USP17L2Q6R6M4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L2Q6R6M4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms