Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LARP1Q6PKG0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
LARP1Q6PKG0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LARP1Q6PKG0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LARP1Q6PKG0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LARP1Q6PKG0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms