Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC8BQ6P9F7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8BQ6P9F7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8BQ6P9F7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC8BQ6P9F7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC8BQ6P9F7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC8BQ6P9F7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.8 ms