Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGB2Q6NT52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGB2Q6NT52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGB2Q6NT52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms