Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCTP1Q6DN14 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MCTP1Q6DN14 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCTP1Q6DN14 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCTP1Q6DN14 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms