Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP350Q5VT06 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP350Q5VT06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP350Q5VT06 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP350Q5VT06 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP350Q5VT06 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP350Q5VT06 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP350Q5VT06 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP350Q5VT06 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms