Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM27D1Q5T7N8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM27D1Q5T7N8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM27D1Q5T7N8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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