Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARS2Q5T160 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARS2Q5T160 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARS2Q5T160 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARS2Q5T160 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms