Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNZ9

WIPI1, WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPI1Q5MNZ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WIPI1Q5MNZ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WIPI1Q5MNZ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WIPI1Q5MNZ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms