Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB2Q5IJ48 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB2Q5IJ48 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB2Q5IJ48 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB2Q5IJ48 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms