Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSD17B12Q53GQ0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSD17B12Q53GQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSD17B12Q53GQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms