Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPRNQ4KMQ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPRNQ4KMQ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPRNQ4KMQ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms