Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01559Q495D7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01559Q495D7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01559Q495D7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01559Q495D7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01559Q495D7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01559Q495D7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01559Q495D7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01559Q495D7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms