Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCL15Q16663 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCL15Q16663 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCL15Q16663 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCL15Q16663 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCL15Q16663 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCL15Q16663 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms