Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCBQ16585 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCBQ16585 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCBQ16585 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCBQ16585 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
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