Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPL1Q16563 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPL1Q16563 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms