Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAPC1Q16533 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAPC1Q16533 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNAPC1Q16533 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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