Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRADDQ15628 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRADDQ15628 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRADDQ15628 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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