Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 27.5
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TRA2AQ13595 NAP1L4-210ENST00000492685 850 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 27.5
TRA2AQ13595 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 27.5
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TRA2AQ13595 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 27.5
TRA2AQ13595 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 27.5
TRA2AQ13595 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 26.3□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 27.5
TRA2AQ13595 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.66e-8■■■■■ 27.5
TRA2AQ13595 RSF1-212ENST00000534794 487 ntTSL 32.29□□□□□ -2.044e-6■■■■■ 27.5
TRA2AQ13595 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-8■■■■■ 27.4
TRA2AQ13595 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 27.4
TRA2AQ13595 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 27.4
TRA2AQ13595 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.07□□□□□ -2.082e-8■■■■■ 27.4
TRA2AQ13595 TAF1-216ENST00000483365 568 ntTSL 27.59□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 27.3
TRA2AQ13595 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 27.3
TRA2AQ13595 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 27.3
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TRA2AQ13595 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 411.43□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 27.3
TRA2AQ13595 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 34.61□□□□□ -1.673e-8■■■■■ 27.3
TRA2AQ13595 GOLGA4-211ENST00000498250 560 ntTSL 23.96□□□□□ -1.789e-10■■■■■ 27.2
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TRA2AQ13595 CHD4-213ENST00000545584 553 ntTSL 419.7■□□□□ 0.748e-9■■■■■ 27.2
TRA2AQ13595 CHD4-202ENST00000430771 527 ntTSL 410.61□□□□□ -0.718e-9■■■■■ 27.2
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TRA2AQ13595 MCM3-203ENST00000421471 1030 ntTSL 59.78□□□□□ -0.847e-7■■■■■ 27.2
TRA2AQ13595 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.977e-7■■■■■ 27.2
TRA2AQ13595 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 27.2
TRA2AQ13595 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 27.2
TRA2AQ13595 SSB-209ENST00000470621 440 ntTSL 34.58□□□□□ -1.682e-7■■■■■ 27.2
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TRA2AQ13595 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 27.1
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TRA2AQ13595 SSR1-209ENST00000488834 585 ntTSL 43.32□□□□□ -1.888e-9■■■■■ 27
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TRA2AQ13595 SLC39A14-208ENST00000519960 467 ntTSL 47.68□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 26.9
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TRA2AQ13595 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 TRIM52-204ENST00000514805 1727 ntTSL 312.92□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 TRIM52-206ENST00000612671 4753 nt11.63□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 TRIM52-205ENST00000611618 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 SPTA1-202ENST00000461624 930 ntTSL 25.29□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-219ENST00000456808 741 ntTSL 415.5■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-214ENST00000435234 1047 ntTSL 314.2□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 26.9
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TRA2AQ13595 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-218ENST00000452242 980 ntTSL 511.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-215ENST00000438879 808 ntTSL 510.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-205ENST00000409453 2552 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-210ENST00000422646 564 ntTSL 46.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 26.9
TRA2AQ13595 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 26.9
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