Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NEUROD1Q13562 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NEUROD1Q13562 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NEUROD1Q13562 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NEUROD1Q13562 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NEUROD1Q13562 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
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