Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COX10Q12887 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COX10Q12887 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX10Q12887 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX10Q12887 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX10Q12887 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX10Q12887 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX10Q12887 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX10Q12887 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COX10Q12887 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX10Q12887 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX10Q12887 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COX10Q12887 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX10Q12887 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX10Q12887 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX10Q12887 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COX10Q12887 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX10Q12887 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX10Q12887 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX10Q12887 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX10Q12887 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX10Q12887 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX10Q12887 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX10Q12887 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX10Q12887 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX10Q12887 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX10Q12887 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX10Q12887 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX10Q12887 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX10Q12887 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX10Q12887 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX10Q12887 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX10Q12887 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX10Q12887 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX10Q12887 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX10Q12887 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX10Q12887 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX10Q12887 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX10Q12887 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX10Q12887 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX10Q12887 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX10Q12887 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX10Q12887 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX10Q12887 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COX10Q12887 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COX10Q12887 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX10Q12887 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX10Q12887 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX10Q12887 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX10Q12887 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX10Q12887 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX10Q12887 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX10Q12887 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX10Q12887 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX10Q12887 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX10Q12887 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX10Q12887 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX10Q12887 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX10Q12887 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX10Q12887 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX10Q12887 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX10Q12887 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COX10Q12887 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX10Q12887 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX10Q12887 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX10Q12887 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX10Q12887 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX10Q12887 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX10Q12887 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX10Q12887 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX10Q12887 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX10Q12887 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX10Q12887 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX10Q12887 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX10Q12887 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX10Q12887 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COX10Q12887 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX10Q12887 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX10Q12887 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX10Q12887 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX10Q12887 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX10Q12887 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX10Q12887 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COX10Q12887 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms