Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC15Q0P6D6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC15Q0P6D6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.7 ms