Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM1Q08AH1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM1Q08AH1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSM1Q08AH1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms