Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUDPQ08623 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUDPQ08623 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUDPQ08623 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms