Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNK2Q07912 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNK2Q07912 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNK2Q07912 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNK2Q07912 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms