Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CKAP4Q07065 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CKAP4Q07065 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CKAP4Q07065 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CKAP4Q07065 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms