Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX1T1Q06455 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNX1T1Q06455 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms