Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSBP1Q04837 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSBP1Q04837 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSBP1Q04837 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms