Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 YPT1YFL038C 621 nt6.2□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 SKI2YLR398C 3864 nt6.2□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 PRS4YBL068W 981 nt6.19□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 CST26YBR042C 1194 nt6.19□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 YPR130CYPR130C 408 nt6.19□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 YHR020WYHR020W 2067 nt6.19□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 STT3YGL022W 2157 nt6.18□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 PDA1YER178W 1263 nt6.18□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 PUP2YGR253C 783 nt6.18□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 TRR2YHR106W 1029 nt6.18□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 DFR1YOR236W 636 nt6.18□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 VMA2YBR127C 1554 nt6.18□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 CYS3YAL012W 1185 nt6.17□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 PEX13YLR191W 1161 nt6.17□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 YNR005CYNR005C 405 nt6.17□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 HTZ1YOL012C 405 nt6.17□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 snR30snR30 606 nt6.17□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 RGT2YDL138W 2292 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 UTR2YEL040W 1404 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 YLL058WYLL058W 1728 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 CEF1YMR213W 1773 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 TPK1YJL164C 1194 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 FBA1YKL060C 1080 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 MIA40YKL195W 1212 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 PRE5YMR314W 705 nt6.16□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 APE4YHR113W 1473 nt6.15□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 HEM2YGL040C 1029 nt6.15□□□□□ -1.42
NUP49Q02199 EDE1YBL047C 4146 nt6.15□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 GPA1YHR005C 1419 nt6.15□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 CIA1YDR267C 993 nt6.14□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 RPR1RPR1 369 nt6.14□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 YCL049CYCL049C 939 nt6.14□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 PPM2YOL141W 2088 nt6.14□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 HGH1YGR187C 1185 nt6.13□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 SMX3YPR182W 261 nt6.13□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 THI2YBR240C 1353 nt6.13□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 CRP1YHR146W 1398 nt6.12□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 PRI1YIR008C 1230 nt6.12□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 SQT1YIR012W 1296 nt6.12□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 RAP1YNL216W 2484 nt6.12□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 NOG2YNR053C 1461 nt6.11□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 LAT1YNL071W 1449 nt6.11□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 RPP1YHR062C 882 nt6.11□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 YLR312CYLR312C 1197 nt6.11□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 TMA46YOR091W 1038 nt6.11□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 DAL4YIR028W 1908 nt6.11□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 RIO1YOR119C 1455 nt6.1□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 COQ1YBR003W 1422 nt6.1□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 YGL102CYGL102C 429 nt6.1□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 ICS3YJL077C 396 nt6.1□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 ATG36YJL185C 882 nt6.1□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 YLR123CYLR123C 330 nt6.1□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 TKL2YBR117C 2046 nt6.09□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 MSY1YPL097W 1479 nt6.09□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 CIS3YJL158C 684 nt6.09□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 YOX1YML027W 1158 nt6.09□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 YNL120CYNL120C 486 nt6.09□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 SEC62YPL094C 825 nt6.09□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 GEF1YJR040W 2340 nt6.09□□□□□ -1.43
NUP49Q02199 HED1YDR014W-A 489 nt6.08□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 YJR154WYJR154W 1041 nt6.08□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 YLR162WYLR162W 357 nt6.08□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 MOD5YOR274W 1287 nt6.08□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.08□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 ICP55YER078C 1536 nt6.08□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 IMA5YJL216C 1746 nt6.08□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 TPO3YPR156C 1869 nt6.07□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 ERG10YPL028W 1197 nt6.07□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 MFG1YDL233W 1377 nt6.06□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 DUS4YLR405W 1104 nt6.06□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 MSC3YLR219W 2187 nt6.06□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 DOT1YDR440W 1749 nt6.05□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 CCC2YDR270W 3015 nt6.05□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 DMA1YHR115C 1251 nt6.05□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 SWD1YAR003W 1281 nt6.05□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 AIM46YHR199C 933 nt6.04□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 AIM24YJR080C 1185 nt6.04□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 SML1YML058W 315 nt6.04□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 KSH1YNL024C-A 219 nt6.04□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 RFC4YOL094C 972 nt6.04□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 RKI1YOR095C 777 nt6.04□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 VPS61YDR136C 573 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 PPM1YDR435C 987 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 DID2YKR035W-A 615 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 YLL056CYLL056C 897 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 YML6YML025C 861 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 COQ3YOL096C 939 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 AIM3YBR108W 2844 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 YJL163CYJL163C 1668 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 RBS1YDL189W 1374 nt6.03□□□□□ -1.44
NUP49Q02199 FET4YMR319C 1659 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 ZIM17YNL310C 525 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 FIT2YOR382W 462 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 PFK2YMR205C 2880 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 COX10YPL172C 1389 nt6.02□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 NUP49YGL172W 1419 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 HXT2YMR011W 1626 nt6.01□□□□□ -1.45
NUP49Q02199 GPI11YDR302W 660 nt6.01□□□□□ -1.45
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