Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIBQ01892 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPIBQ01892 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPIBQ01892 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms