Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MDM2Q00987 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MDM2Q00987 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MDM2Q00987 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms