Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1BQ00975 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA1BQ00975 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA1BQ00975 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA1BQ00975 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1BQ00975 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms