Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HBA1P69905 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HBA1P69905 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HBA1P69905 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HBA1P69905 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HBA1P69905 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HBA1P69905 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HBA1P69905 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HBA1P69905 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HBA1P69905 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HBA1P69905 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HBA1P69905 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HBA1P69905 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HBA1P69905 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HBA1P69905 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HBA1P69905 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HBA1P69905 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HBA1P69905 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HBA1P69905 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HBA1P69905 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HBA1P69905 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HBA1P69905 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HBA1P69905 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HBA1P69905 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HBA1P69905 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HBA1P69905 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HBA1P69905 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HBA1P69905 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HBA1P69905 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HBA1P69905 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HBA1P69905 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HBA1P69905 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HBA1P69905 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HBA1P69905 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HBA1P69905 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HBA1P69905 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HBA1P69905 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HBA1P69905 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HBA1P69905 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HBA1P69905 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HBA1P69905 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HBA1P69905 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HBA1P69905 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HBA1P69905 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HBA1P69905 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HBA1P69905 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HBA1P69905 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HBA1P69905 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HBA1P69905 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HBA1P69905 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HBA1P69905 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HBA1P69905 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HBA1P69905 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HBA1P69905 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HBA1P69905 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HBA1P69905 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HBA1P69905 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HBA1P69905 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HBA1P69905 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HBA1P69905 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HBA1P69905 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HBA1P69905 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HBA1P69905 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HBA1P69905 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HBA1P69905 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms