Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PSMC6P62333 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC6P62333 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC6P62333 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMC6P62333 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms