Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN20P56880 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN20P56880 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN20P56880 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN20P56880 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms