Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52P55327 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52P55327 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPD52P55327 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPD52P55327 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPD52P55327 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPD52P55327 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52P55327 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52P55327 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52P55327 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52P55327 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52P55327 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPD52P55327 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52P55327 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52P55327 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52P55327 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPD52P55327 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52P55327 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52P55327 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52P55327 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPD52P55327 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPD52P55327 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPD52P55327 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPD52P55327 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52P55327 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52P55327 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52P55327 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52P55327 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52P55327 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPD52P55327 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPD52P55327 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52P55327 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52P55327 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52P55327 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPD52P55327 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52P55327 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52P55327 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52P55327 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52P55327 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPD52P55327 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52P55327 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52P55327 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52P55327 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPD52P55327 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms