Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA8P53708 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA8P53708 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA8P53708 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA8P53708 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms