Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE6CP51160 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE6CP51160 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE6CP51160 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6CP51160 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms