Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8P50990 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8P50990 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8P50990 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT8P50990 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCT8P50990 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT8P50990 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT8P50990 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT8P50990 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8P50990 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8P50990 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT8P50990 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8P50990 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8P50990 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT8P50990 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8P50990 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8P50990 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8P50990 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8P50990 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8P50990 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT8P50990 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8P50990 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8P50990 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8P50990 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT8P50990 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8P50990 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT8P50990 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8P50990 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8P50990 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8P50990 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8P50990 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT8P50990 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8P50990 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8P50990 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT8P50990 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT8P50990 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8P50990 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8P50990 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8P50990 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8P50990 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8P50990 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8P50990 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT8P50990 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCT8P50990 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8P50990 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8P50990 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8P50990 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8P50990 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT8P50990 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8P50990 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8P50990 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT8P50990 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT8P50990 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT8P50990 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms