Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF144AP50876 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF144AP50876 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF144AP50876 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144AP50876 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms