Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITPNBP48739 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITPNBP48739 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITPNBP48739 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms